随着皮肤生理学研究的发展，不同的皮肤问题与特定的信号或代谢通路之间的关联也逐渐被揭示。

伴随着信号通路和靶点蛋白的发现，人们也开始逐渐意识到化妆品原料多肽作为一类特异性信号分子，在针对性调控皮肤问题方面的重要性。

化妆品原料多肽组学的兴起使得大量内源性多肽被成功鉴定，其中被研究比较多的是神经多肽和多肽类激素。作为细胞间信息传递的分子，它们在中枢神经系统和内分泌系统中广泛存在，参与体温、能量自稳、昼夜节律等重要生理过程的调控。

内源性多肽性质鉴定、多肽-蛋白的关系网络研究为靶向解决皮肤问题提供了基础；而大量单体多肽的筛选鉴定为未来活性原料的开发提供了无限可能。

在化妆品原料多肽的作用方式上，除了穿膜肽等特殊类别，化妆品活性单体多肽主要通过以下三种方式实现功能：模拟内源性多肽序列，与受体蛋白互作后激活或抑制相应信号通路；模拟酶的底物序列，竞争性抑制酶活；截取两个蛋白接触面上的序列，干扰正常的蛋白互作。这些方式中都涉及到多肽-蛋白或者蛋白-蛋白的互作。

计算辅助化妆品原料单体活性多肽研究应运而生。

多肽-蛋白互作的广泛性使得多肽成为一类可应对不同皮肤问题的重要活性原料。化妆品原料多肽-蛋白的结合通常需要较大的结合面积，对结合面的结构也有要求，因此多肽-蛋白互作能够有很高的特异性。

另外，生物体系的高复杂性，以及化妆品原料蛋白-多肽的互作且一一对应，都可能导致实验设计考虑不全面。报告显示，人体内存在的蛋白-多肽、蛋白-蛋白二元互作估计数值高达3,000,000。如此大量的互作数量，若从实验层面全部证明，不但成本过高，更难以跟上功效护肤产品的日常开发与技术迭代升级节奏。

化妆品原料单体多肽的需求性、多肽筛选和功能鉴定实验的复杂性，共同催生了计算辅助的单体活性多肽研究的发展。计算机可以辅助靶点蛋白折叠、预测蛋白表面多肽的可能结合位点、预测多肽/蛋白-蛋白对接模式等，实现多肽的虚拟筛选。